MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p5

Total Repeats: 4288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016619	CGA	2	6	34	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384559
2	NC_016619	GAT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384559
3	NC_016619	CG	3	6	53	58	0 %	0 %	50 %	50 %	392384559
4	NC_016619	TGC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384559
5	NC_016619	GAT	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384559
6	NC_016619	CCG	2	6	174	179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384559
7	NC_016619	CCG	2	6	325	330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384559
8	NC_016619	GGC	2	6	402	407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384560
9	NC_016619	CAGC	2	8	425	432	25 %	0 %	25 %	50 %	392384560
10	NC_016619	TCAT	2	8	472	479	25 %	50 %	0 %	25 %	392384560
11	NC_016619	CCA	2	6	583	588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392384560
12	NC_016619	GTGC	2	8	607	614	0 %	25 %	50 %	25 %	392384560
13	NC_016619	CCG	2	6	646	651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384560
14	NC_016619	CGG	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384560
15	NC_016619	G	6	6	684	689	0 %	0 %	100 %	0 %	392384560
16	NC_016619	GCC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384560
17	NC_016619	CGG	2	6	718	723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384560
18	NC_016619	GAC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384560
19	NC_016619	CCG	2	6	840	845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384561
20	NC_016619	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384561
21	NC_016619	CCG	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384561
22	NC_016619	GCT	2	6	957	962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384561
23	NC_016619	TC	3	6	963	968	0 %	50 %	0 %	50 %	392384561
24	NC_016619	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384561
25	NC_016619	GCT	2	6	1088	1093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384561
26	NC_016619	TTC	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392384562
27	NC_016619	TGG	3	9	1402	1410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384562
28	NC_016619	CGG	2	6	1423	1428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
29	NC_016619	CGA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384562
30	NC_016619	GAC	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384562
31	NC_016619	GCG	2	6	1578	1583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
32	NC_016619	CGA	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384562
33	NC_016619	CGG	2	6	1630	1635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
34	NC_016619	GCG	2	6	1671	1676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384562
35	NC_016619	ATC	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384562
36	NC_016619	GGT	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384562
37	NC_016619	TGC	2	6	1809	1814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384562
38	NC_016619	GCCG	2	8	1840	1847	0 %	0 %	50 %	50 %	392384562
39	NC_016619	CCAG	2	8	2190	2197	25 %	0 %	25 %	50 %	392384563
40	NC_016619	TCA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392384563
41	NC_016619	CGT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384563
42	NC_016619	CGA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384563
43	NC_016619	CGG	2	6	2476	2481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384563
44	NC_016619	TGGA	2	8	2555	2562	25 %	25 %	50 %	0 %	392384563
45	NC_016619	GATC	2	8	2563	2570	25 %	25 %	25 %	25 %	392384563
46	NC_016619	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392384563
47	NC_016619	ATG	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384563
48	NC_016619	TGGGT	2	10	2643	2652	0 %	40 %	60 %	0 %	392384563
49	NC_016619	CGA	2	6	2668	2673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384563
50	NC_016619	CGG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384563
51	NC_016619	GAG	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392384563
52	NC_016619	CGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384563
53	NC_016619	GCC	2	6	2783	2788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384563
54	NC_016619	ATG	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384563
55	NC_016619	GCT	2	6	2815	2820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384563
56	NC_016619	CGCC	2	8	2932	2939	0 %	0 %	25 %	75 %	392384564
57	NC_016619	GCG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
58	NC_016619	CCG	2	6	2983	2988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
59	NC_016619	CGG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
60	NC_016619	GCC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
61	NC_016619	CGA	2	6	3082	3087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
62	NC_016619	GCT	3	9	3092	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
63	NC_016619	CGCC	3	12	3101	3112	0 %	0 %	25 %	75 %	392384564
64	NC_016619	CCGG	2	8	3113	3120	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
65	NC_016619	GCA	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
66	NC_016619	ACA	2	6	3271	3276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392384564
67	NC_016619	GCC	2	6	3302	3307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
68	NC_016619	GTC	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
69	NC_016619	CAC	2	6	3350	3355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392384564
70	NC_016619	GCC	2	6	3380	3385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
71	NC_016619	GCC	2	6	3395	3400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
72	NC_016619	AGC	2	6	3438	3443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
73	NC_016619	CGC	2	6	3466	3471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
74	NC_016619	GTG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
75	NC_016619	CCGTC	2	10	3583	3592	0 %	20 %	20 %	60 %	392384564
76	NC_016619	GCC	2	6	3632	3637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
77	NC_016619	GCT	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
78	NC_016619	GGCC	2	8	3715	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
79	NC_016619	GGT	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
80	NC_016619	GCC	2	6	3776	3781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
81	NC_016619	CCGCC	2	10	3797	3806	0 %	0 %	20 %	80 %	392384564
82	NC_016619	GTC	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
83	NC_016619	GCC	2	6	3824	3829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
84	NC_016619	GCC	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
85	NC_016619	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
86	NC_016619	GCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
87	NC_016619	TGC	2	6	3958	3963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
88	NC_016619	CCG	2	6	3972	3977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
89	NC_016619	GGT	3	9	3998	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
90	NC_016619	TCG	2	6	4074	4079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
91	NC_016619	CCG	2	6	4281	4286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
92	NC_016619	TGC	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
93	NC_016619	CGC	2	6	4366	4371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
94	NC_016619	GC	3	6	4387	4392	0 %	0 %	50 %	50 %	392384564
95	NC_016619	CGG	2	6	4434	4439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
96	NC_016619	GTG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
97	NC_016619	TGC	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
98	NC_016619	CCG	2	6	4560	4565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
99	NC_016619	GTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
100	NC_016619	CGT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
101	NC_016619	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392384564
102	NC_016619	GGAC	2	8	4657	4664	25 %	0 %	50 %	25 %	392384564
103	NC_016619	CGG	2	6	4693	4698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
104	NC_016619	TGC	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
105	NC_016619	CGC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
106	NC_016619	CGG	2	6	4777	4782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384564
107	NC_016619	CGC	3	9	4810	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
108	NC_016619	CGA	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
109	NC_016619	TCG	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384564
110	NC_016619	ACGG	2	8	4988	4995	25 %	0 %	50 %	25 %	392384564
111	NC_016619	CCG	2	6	5067	5072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
112	NC_016619	GACC	2	8	5189	5196	25 %	0 %	25 %	50 %	392384564
113	NC_016619	CGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384564
114	NC_016619	CGA	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384564
115	NC_016619	CGG	2	6	5302	5307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
116	NC_016619	CGG	2	6	5368	5373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
117	NC_016619	GGC	2	6	5387	5392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
118	NC_016619	GAA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392384565
119	NC_016619	GCC	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
120	NC_016619	GGC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
121	NC_016619	TGC	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384565
122	NC_016619	CG	3	6	5528	5533	0 %	0 %	50 %	50 %	392384565
123	NC_016619	TGA	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384565
124	NC_016619	GCC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
125	NC_016619	GCC	2	6	5673	5678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
126	NC_016619	GTT	2	6	5682	5687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392384565
127	NC_016619	CGC	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
128	NC_016619	GCC	3	9	5742	5750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
129	NC_016619	CGC	2	6	5753	5758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
130	NC_016619	CGT	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384565
131	NC_016619	CCTG	2	8	5798	5805	0 %	25 %	25 %	50 %	392384565
132	NC_016619	CCCG	2	8	5874	5881	0 %	0 %	25 %	75 %	392384565
133	NC_016619	CGC	2	6	5906	5911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
134	NC_016619	CGC	2	6	5924	5929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392384565
135	NC_016619	GGC	2	6	6018	6023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384565
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252	NC_016619	GC	3	6	10203	10208	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
253	NC_016619	TGA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392384568
254	NC_016619	CGG	2	6	10247	10252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384568
255	NC_016619	GCG	2	6	10253	10258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392384568
256	NC_016619	GAC	3	9	10297	10305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384568
257	NC_016619	CTG	2	6	10309	10314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392384568
258	NC_016619	CCGA	2	8	10333	10340	25 %	0 %	25 %	50 %	392384568
259	NC_016619	CG	3	6	10368	10373	0 %	0 %	50 %	50 %	392384568
260	NC_016619	AGC	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384568
261	NC_016619	GAC	2	6	10401	10406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392384568
262	NC_016619	GACC	2	8	10452	10459	25 %	0 %	25 %	50 %	392384568
263	NC_016619	CCT	2	6	10475	10480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392384568
264	NC_016619	CA	3	6	10487	10492	50 %	0 %	0 %	50 %	392384568
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